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高質(zhì)量RNA精準(zhǔn)分選如何實(shí)現(xiàn)?——汪艷教授團(tuán)隊(duì)徠卡激光顯微切割(LMD)應(yīng)用經(jīng)驗(yàn)分享

更新時(shí)間:2026-07-10      點(diǎn)擊次數(shù):146

您是否遇到這些難題?

1. 固定組織(PFA)無法提取高質(zhì)量RNA?

2. 樣本異質(zhì)性強(qiáng),結(jié)果不準(zhǔn)確、不可靠?

3. 單細(xì)胞/空間轉(zhuǎn)錄組成本高、分辨率受限

4. 珍貴病理樣本有限,不足夠開展多個(gè)實(shí)驗(yàn)


例如在肝臟等復(fù)雜組織研究中提取RNA分析面臨以下挑戰(zhàn):

組織異質(zhì)性嚴(yán)重:肝臟包含肝細(xì)胞、膽管上皮、免疫細(xì)胞等,傳統(tǒng)整體提取難以反映真實(shí)表達(dá)差異

空間信息丟失:單細(xì)胞測(cè)序需組織解離,破壞細(xì)胞原位信息

技術(shù)方案受限:空間轉(zhuǎn)錄組:圖像分辨率或通量受限;傳統(tǒng) LCM(Laser Capture Microdissection,激光捕獲顯微切割)大多使用新鮮樣本,無法利用大量病理固定組織

病理固定組織RNA難以提取,降解快,缺乏標(biāo)準(zhǔn)化流程

臨床樣本珍貴:無法轉(zhuǎn)化為高質(zhì)量和足夠的RNA分析數(shù)據(jù)。

激光顯微切割,即LMD(Laser Microdissection)技術(shù),精準(zhǔn)從組織切片中分離目標(biāo)單細(xì)胞 / 特定組織區(qū)域,適配后續(xù)核酸提取測(cè)序。南方醫(yī)科大學(xué)汪艷教授團(tuán)隊(duì)發(fā)表于Journal of Visualized Experiments的工作中,第一作者曾偉蘭博士作為方法學(xué)核心執(zhí)行人,依托學(xué)??蒲兄С种行模ㄖ行膶?shí)驗(yàn)室)平臺(tái)及該平臺(tái)配備的徠卡LMD激光顯微切割系統(tǒng),成功構(gòu)建了一套從固定組織到RNA測(cè)序的標(biāo)準(zhǔn)化解決方案,實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)到單細(xì)胞級(jí)別分選,兼容PFA固定+冰凍切片樣本,5天內(nèi)完成從取材到測(cè)序建庫,1000個(gè)細(xì)胞即可獲得高質(zhì)量RNA分析結(jié)果的實(shí)踐方案。該方案提供了一套完整可重復(fù)的標(biāo)準(zhǔn)化實(shí)驗(yàn)流程:樣本制備 → LMD 精準(zhǔn)切割 → RNA提取 → qPCR / RNA-seq。

真正實(shí)現(xiàn):固定組織 → 精準(zhǔn)分選 → 高通量分子分析

圖1.png


關(guān)鍵技術(shù)突破

01、固定組織RNA提取優(yōu)化

控制PFA固定時(shí)間24h,避免蛋白-核酸過度交聯(lián)不可逆損傷RNA

優(yōu)化解交聯(lián) + 蛋白酶K消化體系,提高RNA釋放效率

RNase全流程控制,保障RNA穩(wěn)定性

02、高效LMD取樣策略

快速蘇木素染色替代復(fù)雜免疫染色

單張切片30–60min內(nèi)完成切割,全部切割4h內(nèi)結(jié)束,高效完成目標(biāo)采集

精準(zhǔn)圈選目標(biāo)細(xì)胞群,避免污染

03、微量樣本高質(zhì)量輸出

1000 cells → \~110 ng RNA

A260/A280:1.9–2.1

文庫片段:300–500 bp(符合測(cè)序要求)

該方案從臨床到科研全面釋放樣本價(jià)值:

肝病機(jī)制研究(MASH、肝損傷、纖維化等)

特定細(xì)胞群表達(dá)譜分析

微環(huán)境與免疫細(xì)胞研究

固定病理樣本回顧性研究


為什么選擇徠卡LMD激光顯微切割系統(tǒng)

高精度激光切割,細(xì)胞級(jí)分辨率

參數(shù)可控,適配不同組織類型

可在空間背景下通過可視化控制,實(shí)現(xiàn)純凈、無接觸、無污染的樣本采集

具備高通量處理能力,適應(yīng)下游質(zhì)譜等分析需求

樣本采集使用標(biāo)準(zhǔn)耗材,通用方便

LMD激光顯微切割系統(tǒng)不僅是一臺(tái)激光顯微切割顯微鏡,更是一套完整DVP解決方案,將細(xì)胞顯微結(jié)構(gòu)與分子連接,打開病理樣本高價(jià)值再利用的可能。


汪艷教授團(tuán)隊(duì)優(yōu)化的LMD顯微切割步驟:

本流程參考了既往文獻(xiàn)的LMD通用操作規(guī)范,并針對(duì)固定組織中RNA易降解的特性,進(jìn)行了優(yōu)化調(diào)整。

1.用去除RNase試劑擦拭實(shí)驗(yàn)臺(tái)面與儀器表面。

2.開啟LMD控制器,等待顯微鏡完成初始化。

3.擰動(dòng)激光器鑰匙至開機(jī)檔位,啟動(dòng)LMD激光系統(tǒng)。激光預(yù)熱10分鐘。

4.打開電腦及LMD軟件,等待軟件初始化結(jié)束。

5.將0.2mL PCR管裝入收集裝置。

6.在PCR管蓋中加入10μL RNA提取緩沖液(RNeasy FFPE 試劑盒配套試劑)。

7.將收集裝置裝回顯微鏡。

8.在LMD收集設(shè)備設(shè)置界面,點(diǎn)擊 “移至參考點(diǎn)",調(diào)節(jié)相機(jī)焦距使參考點(diǎn)成像清晰,必要時(shí)通過方向按鍵將參考點(diǎn)調(diào)至視野中央,進(jìn)行收集設(shè)備位置校準(zhǔn)。

9.組織切片面向下、標(biāo)簽朝右裝入標(biāo)本夾。

10.選用10倍物鏡定位樣本區(qū)域,進(jìn)入激光菜單點(diǎn)擊校準(zhǔn),彈窗選擇確認(rèn)。

11.設(shè)置激光參數(shù)(供參考):Power 50、Aperture 5、Speed 9。

12.工具欄圈選目標(biāo)區(qū)域,選擇單一圖形,點(diǎn)擊開始切割;組織粘連無法自動(dòng)掉落時(shí),可選用手動(dòng)裁切模式。警示:操作中禁止直視激光束,防止輻射損傷。

13.可通過軟件菜單保存切割前后鏡下畫面。

14.收集足量細(xì)胞后卸下收集組件,再次向管蓋補(bǔ)加提取緩沖液至終體積10μL,密封PCR管。

15.充分渦旋混勻收集管。

16.短暫離心,樣品- 80℃保存待用。后續(xù)樣本重復(fù)5~16步,切割結(jié)束可暫停實(shí)驗(yàn),待統(tǒng)一提取RNA。

注意:單張玻片樣品顯微切割用時(shí)控制在30分鐘~1小時(shí),全部切割操作建議4小時(shí)內(nèi)完成。


相關(guān)產(chǎn)品


產(chǎn)品1.jpeg

激光顯微切割 Leica LMD6 & LMD7


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